Evaluación de la presencia entre generaciones de los genes SIX (secretado en xilema) en Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici

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2020
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Zamorano: Escuela Agrícola Panamericana, 2020.
Resumen
El tomate es una de las hortalizas más importantes en el mundo, siendo afectada severamente por el hongo fitopatógeno Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici. El estudio del proteoma de la savia del xilema es de vital importancia, ya que determina la presencia de los genes de avirulencia, llamados genes SIX (secretados en xilema). El objetivo de este estudio fue, evaluar la presencia de los genes SIX1 y SIX3 a través de la generación madre, primera generación y segunda generación de siete aislamientos de Fusarium oxysporum f. sp. lycopersici y un aislamiento de Fusarium oxysporum f. sp. radicis-lycopersici. El total de aislamientos en todas las generaciones fue de 168. Se extrajo ADN y se evaluó la presencia de los genes a través de PCR con el uso de primers específicos para cada gen. Se realizaron mapas de calor para obtener un análisis visual de datos de la expresión génica del hongo en los aislamientos. Se demostró que existe un fenómeno de presencia y ausencia de genes SIX entre generaciones, así como diferencias en morfología. Se determinó que el fenómeno está sucediendo con mayor proporción en el gen SIX1 y en menor proporción en el gen SIX3. La causa de este fenómeno de presencia y ausencia de genes SIX entre generaciones, está ligada a su ubicación en el cromosoma 14 del genoma de Fusarium oxysporum, el cual es transferido horizontalmente. Sin embargo, es recomendado secuenciar el producto de la PCR, para obtener un factor preciso que determine la causa de este fenómeno.
Descripción
Palabras clave
ADN, Genoma, Patogenicidad, Primers, Virulencia
Citación