Optimización de protocolo para extracción de ADN y perfil térmico para marcador molecular tipo SCAR T1 en cultivo de papaya Carica papaya L.

Abstract

La papaya Carica papaya L. es nativa del trópico americano y es la tercera fruta tropical de mayor consumo a nivel mundial representando una gran importancia desde el punto de vista económico y social. Es una especie trioica, para los productores es necesario la detección temprana del sexo de las plántulas para llevar a campo definitivo solo las hermafroditas. Los objetivos de este estudio fueron optimizar el protocolo de extracción de ADN y el perfil térmico del cebador T1 en el cultivo de papaya. Para llevar a cabo este estudio fue necesario determinar la cantidad de tejido a utilizar y la calidad del ADN mediante la optimización del protocolo de extracción de ADN para frijol Phaseolus vulgaris L. y se optimizó el perfil térmico del cebador T1 estableciendo diferentes gradientes de temperatura en el termociclador específicamente para la fase de hibridación (59.9 °C, 60°C y 60.1°C). La cantidad de tejido optima que se debe utilizar es de 1 cm2 y se debe agregar un lavado adicional con alcohol al 70% para obtener ADN de calidad y alta concentración (>30 ng/μl). La temperatura de hibridación del cebador T1 fue de 60 °C amplificando tanto en las muestras de las plantas con flores hermafroditas, macho y femeninas a 1300 pb. Se optimizó el protocolo de ADN para cultivo de papaya con altas concentraciones y de buena calidad y se optimizó el perfil térmico del cebador T1 el cual amplificó en muestras de ADN proveniente de plantas con flores hermafroditas, machos y hembras.