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Title: Optimización de los protocolos para el marcador SCAR BAC6 y de PCR múltiple con los marcadores SCAR SAP6 y SU91 de la resistencia a la bacteriosis común del frijol
Authors: Chavarría H., Roberto C.
Rosas, Juan C.
Guachambala, Marcelino
Berger, Nils
Pitty, Abelino
Keywords: Acoplamiento
Optimizar
PCR
Phaseolus vulgaris
QTL
Resistencia
Validar
Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli
Issue Date: 2010
Publisher: Zamorano: Escuela Agrícola Panamericana, 2012
Abstract: Chavarría, R. 2010. Optimización de los protocolos para el marcador SCAR BAC6 y de PCR múltiple con los marcadores SCAR SAP6 y SU91 de la resistencia a la bacteriosis común del frijol. Proyecto especial de graduación del programa de Ingeniería Agronómica, Escuela Agrícola Panamericana, Zamorano. Honduras. 19 p. El frijol común (Phaseolus vulgaris) es uno de los principales componentes en la dieta tradicional y una de las principales fuentes de proteína de América Latina y África. La bacteriosis común en frijol causada por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, es una de las enfermedades que limitan su producción y puede ocasionar pérdidas en el rendimiento hasta el 40%. La resistencia genética a esta enfermedad ha sido identificada como de loci de carácter cuantitativo (QTL, por sus siglas en ingles). La estrategia más efectiva y ambientalmente segura para controlar esta enfermedad es el desarrollo de cultivares resistentes con la ayuda de la selección asistida con marcadores (SAM). La reacción en cadena de la polimerasa (PCR, por sus siglas en inglés) múltiple permite amplificar e identificar simultáneamente dos o más marcadores. El objetivo de este estudio fue optimizar los protocolos para el marcador BAC 6 y la PCR múltiple de los marcadores SAP 6 y SU 91 para ampliar la capacidad de selección asistida con marcadores para la resistencia a esta enfermedad. Para la optimización del marcador BAC 6, se utilizaron los genotipos resistentes VAX 6, VAX 3, GN Weihing, XAN 176, BAT 93 y el susceptible Catrachita; y para la validación de este protocolo se utilizaron 35 genotipos de reacción conocida (susceptibles y resistentes). El protocolo de la PCR múltiple fue optimizado utilizando los genotipos Amadeus 77 y VAX 6. Se utilizó la prueba χ2 (Chi-cuadrado) para determinar la concordancia entre los valores esperados y los observados de la presencia o ausencia del QTL identificado en la variedad GN#1 Sel 27, asociado al marcador BAC 6. Las principales variaciones fueron en los reactivos ddH₂O, buffer PCR, dNTP´s con y sin MgCl₂, la temperatura de acoplamiento y el número de ciclos de la PCR. Se optimizó y validó el protocolo del marcador BAC 6 utilizando una temperatura de acoplamiento de 73°C y 25 ciclos, y se optimizó el protocolo de PCR múltiple de los marcadores SAP 6 y SU 91 a una temperatura de acoplamiento de 65°C. Estos marcadores serán usados en SAM en el programa de mejoramiento genético de frijol en Zamorano.
Description: 19 p.
URI: http://hdl.handle.net/11036/582
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